Chai Discovery推出Chai-2模型：在零样本抗体设计中达到16-20%的命中率突破

Chai Discovery于2025年6月30日发布了其最新模型Chai-2，该模型在零样本抗体设计方面取得了重大突破。以下是关于Chai-2模型的详细介绍：

模型特点

• 全原子结构建模与生成设计模型结合：Chai-2将全原子结构建模与生成设计模型相结合，能够基于给定的表位和目标结构，从头设计全新的抗体序列，无需依赖现有的抗体模板或训练时的支架。

• 支持多种抗体形式：该模型支持设计单链可变片段（scFv）、VHH纳米抗体等多种抗体形式，以及小蛋白支架。

• 广泛的应用能力：Chai-2不仅局限于传统的生物制剂，还能够处理配体和翻译后修饰，并且有望扩展到大环化合物、酶和小分子的设计，通过在原子水平上建模相互作用潜力。

• 复杂设计任务的支持：该平台还支持更复杂的设计任务，如多特异性结合剂和交叉反应性结合剂的设计。

实验结果

• 抗体设计成功率：在对52个以前未被研究的抗原进行实验验证时，Chai-2在标准24孔板格式下，每个目标测试20个候选抗体，平均命中率达到了16-20%。其中，VHH抗体的命中率为20.0%，scFv抗体的命中率为13.7%。在52个目标中，有26个目标至少有一个成功的结合剂，表明Chai-2能够为一半的评估蛋白质创建全新的抗体。

• 小蛋白设计成功率：在小蛋白设计方面，Chai-2在5个测试目标上实现了68%的湿实验室成功率，通常能够产生皮摩尔级别的结合剂。

技术进步

• 抗体-抗原复合物预测精度提升：与Chai-1模型相比，Chai-2在抗体-抗原复合物预测的高精度率上翻了一番，DockQ > 0.8的测试案例达到了34%，这突显了其在原子级建模方面的改进。

• 设计优化能力：Chai-2还能够针对特定的治疗要求进一步优化设计，例如物种交叉反应性。

未来展望

• 零样本治疗药物设计：Chai团队设想未来的模型将纳入制造、药代动力学、粘度和表达的设计约束，目标是在单次计算机模拟中生成IND（新药临床试验申请）就绪的生物制剂。

• 安全和双重用途治理：为了支持安全和双重用途治理，Chai在选择性地向学术界和工业用户授予访问权限时，遵循其“负责任部署”政策，优先考虑具有明确健康和社会效益的项目，同时限制对不安全或在道德上有争议的分子设计的工作。

Chai-2模型的发布，标志着在零样本抗体设计领域迈出了重要的一步，其高成功率和广泛的应用能力为未来的生物制剂发现提供了新的可能性。